在本世纪初，因为恐怖分子袭击阿赖耶识研究所基因实验基地的关系，导致特殊病毒的泄露，从此人类的大脑当中出现了变异，开始能够看到一些幽灵般的存在——“phantom（怪灵）”。而在此次事件前后出生的孩子当中，一部分人就拥有能够跟怪灵战斗的能力，为此防卫省也于中小学内成立“脑功能异常对策室”，安排孩子们解决怪灵问题。主人公·赫塞亚学院高一学生一条晴彦便是其中的一员，而他跟前辈川神舞、被称为“怪灵吞噬者”的和泉玲奈以及“反怪灵要员”水无濑小糸一起投入到同怪灵的作战，然而世界的真相还在等待他们去揭开……
神奈川县，金泽百景。学生北条文太郎并没有“将来想要做什么”这种明确的梦想。怀着隐约的焦躁感，他与朋友们热闹地度过每一天。
某天，文太郎被自己有些在意的异性同学黑田砂雪拜托，希望让他帮忙制作并发售美少女游戏。砂雪看到了文太郎为演剧部写的绝妙脚本，并因此相中了他。对于完全不了解美少女游戏的文太郎来说，这实在是不切实际。但，砂雪拥有能令事物实现、成功的力量和眼光。
在尽是问题儿童的人才当中，游戏能成功地制作出来吗？能卖得出去吗？能得到些什么吗？年轻人们向着无尽的荒野迈出了脚步——
故事讲述原本因为家庭因素而不得不分居的姬小路家兄妹，如今终于能重逢并住在同一个屋檐下。面对恋兄情结严重的妹妹秋子强势相逼，身为哥哥的秋人到底该怎么处理呢？除此之外，绰号”捕食者”的学生会长、冰山美人的副会长竟然也加入了争夺秋人的行列，看来未来于新学校的校园生活也不可能平静度过。
故事的舞台设定在神奈川县江之岛的湘南，讲述进入了高中音乐系的坂井和奏却在半途因为母亲突然去世在自责的情况下放弃了音乐的道路，之后便转入了普通系，在她升入高中三年级时，以与宫本来夏、冲田纱羽的相遇为契机加上田中大智与新生前田敦博组成了合唱和羽毛球部，就这样再次与音乐相联系，青春群像剧也正式开演了。
然而与此同时，由于理事长的商业规划，学校正一步步走向消亡，而同学们大都不知情……
高中男生头脑中时常会充满了一堆胡思乱想，不停的藉由作蠢事来讴歌高中生青春。自称非常平凡的高中生的主角忠邦，他在本作三人组之中扮演著常识人一角，并拼命吐槽两个死党秀则与吉竹，但是偶尔也会被他们牵著鼻子走。在三人组中扮演着青春烦恼导师的秀则，时常与吉竹一搭一唱，试图解开一般高中男生的烦恼（只是试图…）。
立志成为绘本作家的高中生仲上真一郎和被仲上家领养的在同一高中就读的汤浅比吕美，还有父母4人一起生活。有一天，真一郎在学校的后院和爬树后掉下的少女石动乃绘相遇。乃绘由于过去发生的某件事而变得流不出眼泪。真一郎在和她相遇之后，同比吕美、亲友野伏三代吉、青梅竹马安藤爱子之间的关系还有自己自身的想法都产生了很大的动摇。他们为了各自的事而烦恼，摸索自己着必须要做的事，逐渐成长。
九文学园第二新闻部所属的赤松勇树，某一天被社长二阶堂彩香指派负责撰写校内新闻的新专栏「烦恼咨询」（人生咨询）。但是彩香不放心把记事交给勇树一个人，因此找来了三名「回答者」——理科代表的远藤梨乃、文科代表的九条文、体育科代表的铃木郁美协助勇树，勇树必须把她们三个人的回答总结起来并作成记事……
阿斯特拉艾亚的山丘上，建有三家女子学校。圣米雅特尔女子学园（圣ミアトル女学园）、圣斯毕卡女子学院（圣スピカ女学院）、圣露·莉姆（圣ル·リム女学校）女子学校。而且，在那片土地的尽头是三家学校共用的宿舍—-草莓宿舍。阿斯特拉艾亚的山丘…那里是不允许男子踏入的神圣领域…
优等生村雨纯夏喜欢上了自己的同学风间汐，但是一直没机会能好好传达她的心意而深感郁闷。这两人的身边聚集着形形色色的同伴们：食欲旺盛的乐队成员鸟追きより，少女时尚杂志的模特朱宫正树，以及莲贺朋绘和当麻都子这对百合情侣等等。某日由“成立一个放学后只有女生一起玩的社团吧”的话题引发了事端。
主人公前田一也是在光河学园就读的高校二年生，在平凡的度过了整个暑假之后，在暑假的最后一晚从父亲那里接到了一台单反相机。从来没对相机感兴趣过的主人公，一拿到这台单反照相机，便爱上了它沉重的手感和强大的机能。“总而言之，明天拿到学校去拍些照片吧。”这便是一成不变的每一日，开始变化的瞬间…