五河士道只是一名普通的高校二年生，然而在在四月十日，随着一场奇怪的大爆炸（空间震），意外的与一名身穿盔甲手持大剑的神秘少女相遇。这名少女的正是所谓的“精灵”，是会给世界带来灾难的存在，因此这名少女也正遭到对“精灵部队·AST”的攻击。于是，有着会去帮助有困难、有悲伤的人的温柔性格的士道，主动提出要与精灵进行交涉的任务，随后，士道发现了自己拥有的特殊体质，那就是可以通过接吻，来封印（吸收）精灵力量的能力，并且将精灵受到致命伤恢复再生的能力。
故事叙述就读于埼玉县某中学的平凡中学生主角满潮永澄，在暑假时于濑户内海祖母家游玩，而在海中遇溺之时遭人鱼少女濑户拯救，但因人鱼世界中的一条规矩，被人类看见人鱼真身的话，双方中的一方就必须选择死亡，而能回避这向规矩的最后手段，就是成为人鱼家族的一员。
灿借此机会向永澄求婚，但遭到灿的父亲豪三郎的极力反对，而豪三郎乃是人鱼族的黑社会集团濑户内鱼类连合濑户组的老大，这桩婚姻却不被灿的黑道老爸看好，甚至从中作梗破坏。灿追随著永澄来到了他所就读的矶野第三中学校，充满暴力（？！）风情的青春爱情喜剧就此拉开序幕。
“失在羊群之中的狼,被寂寞的利齿撕裂自己的身体”。自幼丧母的高城一砂，从小被父亲好友江田夫妇收养，一直不知道父亲及姐姐千砂的消息。一日一砂晕倒在画室，内心烦躁不安，回到小时候一家人生活在一起时住的老宅，无意间遇见一位长发及肩的少女，她就是姐姐高城千砂。仓促间姐弟相认，一砂得知两个出人意料的事实——一是他们的父亲已死于自杀，另外就是他们高城家族流传着诡异的血统，容易得上嗜血的怪病！！而千砂和一砂都不幸成为这种病的受害者。千砂不断亲近一砂，不但因为两人同病相怜，还因为一砂长得酷似父亲，而千砂对父亲有一种难以言说的依赖感…后来姐弟两人在老宅相互扶助着生活，彼此产生了超越亲情的“第四类”感情。然而千砂的身体愈加虚弱，最后在一砂身边静静辞世。绝望的一砂服下了毒药。可怜他并没有死，连病也奇迹般痊愈了，终于成为一个普通人。失去的，只有记忆而已……“我们不是狼，我们只是长着獠牙的羊”。
神魔，是从黑暗世界中逃出的潜伏在人们心灵软弱处将人类引导入死亡的一种东西……而将这样神魔再次赶入黑暗世界的就是一位美丽的吸血鬼——美夕。
《吸血姬美夕》TV版中，故事围绕着吸血鬼美夕与她的一个非常可爱的小宠物死无，以及她的朋友（关系暧昧）拉法与神魔间的斗争展开的。基本上是一集打跨一个神魔的单独小故事，但是其中穿插着美夕与一心要打倒她的雪女冷羽和最后的神魔、亦即美夕的好朋友千里之间的恩怨作为主线。
美夕是东方的吸血鬼，奉命守护自己的魔界，与西方习惯意义上的吸血鬼不同，她不是为了伤害人类而存在的恶鬼，而是降妖驱魔的吸血姬。但由于她独特的身份和封印神魔的方式，再加上人与魔不断的互相纠缠，使得吸血姬美夕成为一个在作品中毁誉参半的主角，她救过很多被神魔纠缠的人，也将不少和神魔纠缠甚深的人类送到了冥。就如同双刃剑一般，无法断言成败得失，但相信很多读者都认同于吸血姬美夕的主要原因在于：美夕每一次将人类送到冥间之时，都可以感受到美夕的无奈和发自她心底的悲伤。
从梦中惊醒的少女，突然注意到自己在什么东西里面，很柔软的东西，还有从对面传来的声音···。（砾）发现了Old Home的一间房里有一个很大的“茧”正在形成，便急忙开始了准备。原来是同族的新成员要诞生了。
过不大一会儿，好像是受声音的引导，一位少女从“茧”中诞生了。Reki她们（被称为“灰羽”，像天使一样背上生有灰色的羽翼，头上则有优美的光环）正在欢迎她呐。因为一直做着不断落下（Rakka）的梦，所以给她取名叫 Rakka。她的背上果然也生有羽翼，被接受为“灰羽”家族的成员。
在“灰羽”的同族们和“灰羽联盟”的保护下，Rakka在小城里过着安稳的生活。但是，她为什么变成了灰羽，自己究竟是什么，从哪里来的等等，她什么也想不起来了，这令她非常不安···
某天，世界连结到了一起。突然打开的门Highlow，将5个世界连结。
我们所居住的蓝色世界——地球
夜与魔法所支配的黑色世界——Darkness Embrace
祈祷与诸神所守护的红色世界——Terra Rubri Aurora
科学与电脑所管理的白色世界——System White Egma
武器与军队所统治的绿色世界——Gruneschild
天使、恶魔、妖精、魔女、女神。仅在童话中出现的存在，以现实之物现身。
与此同时，觉醒了特殊能力——Excceed的少女们，开始出现在各个世界。
她们被称作“Progress”，并被集中到对她们展开保护、育成的巨大学园都市“青兰学园”。
在这所学园中，少女们相遇了。
与一同编织起牵绊的伙伴们一起。面对5个世界共同的敌人，将世界导向终焉的“Uroboros”。
这个世界，将要失去。能将其拯救的，唯有被选中的少女Progress们——。
贫困国家“雨之公国”拥有降雨能力的第四公女妮可·鲁梅露希耶拥有呼风唤雨的特殊能力。
某一天，晴之王国来信表示可承认雨之王国为特殊自治区，交换条件是须与雨之王国的公主缔结婚姻。为了国家，妮可咬着牙不情不愿地嫁给了“晴天大国”的太阳王里维斯一世。
虽曾听闻过里维斯一世即位三年就达成了征服世界的伟业，甚至被封了“世界王”的荣誉，但她却没想到这位大名鼎鼎的太阳王居然是个比自己年幼的小孩子。而且利比因为一些无聊的理由让妮可降雨，引起了妮可的感到十分不满。但是，随着两人一同渡过许多危机后建立起深厚的信任，妮可自己决定留在里维斯身边，感情也变得更加强深厚，最终结婚，命运之轮也正式开始转动了。
曾经约定了的哦，一起离家出走。陪着佑一起到你想到的地方去……
在函馆生活的少女–遥的春假，有一天，遥看到在教会的尖塔上有个被蓝色光辉的雪所包围的男子。而这个男子的真实身份就是从15年后的另一个世界-拉库利玛时空界而来的龙骑兵“鸦”。也就是她的青梅竹马-佑成人的姿态。
15年后的世界，那里是用高度科学的力量保护人类世界的“拉库利玛时空界”和企图把所有的时空全部消灭的“香格里拉时空界”之间激烈战斗的时代。在拥有压倒性力量的“香格里拉时空界”猛烈进攻下，“拉库利玛时空界”的防御崩溃只是时间的问题。为了寻找阻止香格里拉进攻的“钥匙”-“龙之转矩”的存在，“拉库利玛时空界”司令部决定把龙骑兵“鸦”送往15年前的世界捕获“龙之转矩”。
有一个和我们所生存的的地方非常相似，充满了魔力的世界。在那里，到处都是战乱和灾荒。
魔力，那是出现年幼的少女身上，随着年龄的增加渐渐消失的谜一般的力量。拥有那种力量的少女们不需要手就能移动东西，使之漂浮空中，还可以借由魔力生成领域来保护别人。被称为魔女的她们，受人尊敬，予人畏惧。
高中二年级的春天，菜穗收到了“信”。寄信人是，10年后的自己。
最初以为是恶作剧，但信上所写的内容一一在现实中发生，而“信”中也提及了今后会发生的事。
自己喜欢上转校生翔的事。以及，在17岁的冬天，翔会去世的事。
失去了翔的〈26岁的菜穗〉的后悔与愿望，得知这些的〈16岁的菜穗〉可以做些什么？