在某私立学校（私立アミティーエ学园）上学的主人公长濑准一和妹妹长濑凑一起过着只有两人的平凡生活。一天傍晚，准一在街上救了一名被不良少年拉住的少女，事后不但忘记告诉少女自己的名字，同时还被仓皇逃去的不良少年喊出了当初的黑暗称号“下中的Genokiller”（Genocide killer-大量虐杀者/灭绝屠戮者）。
第二天，准一的班上来了一个转校生，她正是准一前一天所救的少女：片桐优姬，片桐财团的大小姐。两人成为了好朋友，但是在损友的鼓促呼巄下，当着全班的面吻了优姬，因而被她讨厌，但当天傍晚优姬却出现在准一家门前，并透露了婚约之事，之后展开了三人同居的日子，痛苦和甜蜜关系即将开始，准一的生活会发生什么样的变化呢……
位于日本超偏远地区的某家粗点心（古早味零食一类）店中，有一位梦想著成为漫画家的少年鹿田九，但他却被自己的父亲鹿田洋以半强迫的方式要求继承店面经营。此时一位拥有亮丽外表的千金大小姐枝垂莹突然登场，并透露出洋身为业界名人的事实。以此为契机，一连串环绕着这家小店的粗点心喜剧就此开演！
主人公小森唯是一名除了有灵感体质以外普通的高中二年级学生，某日，因为父亲的工作调动以及不吉利的传言而转了学校，同时还住进了被称为“妖怪公馆”的地方。与在那里的六名兄弟同居的日子里，她发现他们并不是普通的人类，于是不安与恐怖的新的学园生活正式拉开帷幕……
故事主要讲述了3个少女和9个少年去旅行。 像明治大正一样的古老街道， 街上的人们皆穿着日式服装， 并且存在着与那样的街道极不相称的巨大球体。 仿佛丢失了重力这个概念一样慢慢地在空中飘浮着， 那个球体的名字是「NORN」。是载着年轻人们在天空旅行的广大的船……
天生拥有一头如红苹果般美丽发色的少女，白雪，拒绝成为恶名昭彰的拉冀王子的爱妾，困扰的她剪下她那一撮红发后离家出走，在逃跑到邻国克拉利涅斯的森林时，在那里的木屋遇到了刚偷偷出城玩克拉利涅斯王国的第二王子千，以及他的随从光秀和木木。而后在与千成了朋友并知道了他的真实身分后，自己决定在克拉利涅斯王国留下来，并决心以自己的力量来成为千的助力……
故事讲述原本因为家庭因素而不得不分居的姬小路家兄妹，如今终于能重逢并住在同一个屋檐下。面对恋兄情结严重的妹妹秋子强势相逼，身为哥哥的秋人到底该怎么处理呢？除此之外，绰号”捕食者”的学生会长、冰山美人的副会长竟然也加入了争夺秋人的行列，看来未来于新学校的校园生活也不可能平静度过。
1998年，冬。
一位普通学生——折原浩平，在这个日常的世界中，又将重新出现在这里。
那里像夜深人静的积雪一样，重复着日常中毫无变化的景象。
无论何时，那里都是已看惯了的风景。
连喜欢的事都没有注意到，没有注意到非常喜欢的人的温暖……
这就是作为自己全部维系在这个世界的东西。
那时候，终于要去寻找那羁绊，那重要的人……
从那时候开始，不久以后季节将在阳光中开始闪耀。
站在那里的浩平，他将在怎样的世界里，把握这寻求的方法？
这是一段注定是充满悲伤的半人半妖与人类相爱的故事。6岁的少女竹川萤，在暑假回到乡下爷爷家的路上，于住满山神、妖怪的“山神之森”迷了路。这时，一名戴着面具的少年阿金（一开始翻译是阿金后来改作阿银），答应把萤带出森林。阿金是一位半人半妖的少年，若他一触碰到人类便会消失，所以萤不能触碰到阿金。之后，在每一年的夏天，萤都会回到乡下，希望与阿金重聚，年复一年，变得亭亭玉立的萤与阿银之间也产生了相恋的感觉，可是他们连相互触碰也做不到。后来阿金答应带着萤去参加妖怪的祭典，两个人的手用绑着白布，就想在约会一样。最后祭奠结束的时阿金因碰到人类而即将消失，但是阿金却笑着对萤说：“来吧！萤！我终于可以碰你了！”两人紧紧的拥抱在一起，虽然只是一瞬间，但对他们来说是永恒的。阿金最终化为点点荧光，消失在夜空中。
立志成为绘本作家的高中生仲上真一郎和被仲上家领养的在同一高中就读的汤浅比吕美，还有父母4人一起生活。有一天，真一郎在学校的后院和爬树后掉下的少女石动乃绘相遇。乃绘由于过去发生的某件事而变得流不出眼泪。真一郎在和她相遇之后，同比吕美、亲友野伏三代吉、青梅竹马安藤爱子之间的关系还有自己自身的想法都产生了很大的动摇。他们为了各自的事而烦恼，摸索自己着必须要做的事，逐渐成长。
阿斯特拉艾亚的山丘上，建有三家女子学校。圣米雅特尔女子学园（圣ミアトル女学园）、圣斯毕卡女子学院（圣スピカ女学院）、圣露·莉姆（圣ル·リム女学校）女子学校。而且，在那片土地的尽头是三家学校共用的宿舍—-草莓宿舍。阿斯特拉艾亚的山丘…那里是不允许男子踏入的神圣领域…