遵从父亲的遗言，将吾转入了有许多财政界千金就读的深流院学园。
所谓的遗言，“在学校里找到可以成为人生伴侣的女性”……总之就是交个女朋友。
然而此时将吾却得知了自己有一个并未见过面的妹妹。
将吾生日当天，收到了一个来历不明的蛋糕，手机铃声也随之响起。
“哥哥，祝你生日快乐！我思念您很久了。“
——似乎妹妹也在这个学院里，隐瞒着身份正在接近将吾！？
将吾是否能“真正“和妹妹相认，并交到女朋友！？魅惑而另类的爱情喜剧，即将展开！
故事讲述当“魔神”自暗黑深渊苏醒，命运之神将会挑选出六名勇者，授与其拯救世界的力量。自称地表最强的少年亚德雷，获选为六位“六花勇者”之一，并前往战地阻止魔神复活。然而不知为何，在约定之地集结的却有七位勇者!? 紧接着雾幻结界随之启动，将七人全数困在森林中。发现其中混入一名内奸后，勇者们变得疑神疑鬼，人人自危。而首当其冲遭受质疑的，正是亚德雷！
煌历3015年，世界因两个超级大国的冷战而四分五裂，原本守护岛国尼尔·卡姆伊的“红龙”发生异变而暴走。为此，来自三国的精英们组成了名为“混成调查队”的部队，岛国的命运将背负在他们的身上。而尼尔·卡姆伊统治者一族“煌统种”的末裔忌布基，则与“红龙”结下契约而成为“契约之子”，获得了需要以朋友的灵魂为代价的“龙之力”，无意继承王位的他却被推到了战斗的中心
红真九郎是处理麻烦事件的经营者，现在读高中一年级。某一天，前辈红香给他介绍了一个工作，就是保护一位幼小的少女。而这名少女的名字叫九凤院紫，是世界上屈指可数的大财阀的千金。真九郎被有些任性又吵闹的紫弄得团团转，但对于这样热闹又温暖的日子也逐渐习惯起来。可是，这种平静忽然被打破了……
真九郎向紫所背负的命运发起了挑战，他还能坚持守护住紫吗？
私立莉莉安女子学园创立于明治三十四年，原本是为贵族的千金小姐而设，是一所具有深厚传统的天主教女子学园。学园位于东京郊外的武藏野，四面环翠，被诸神守护，是为少女提供幼儿园直通大学的精英教育的乐园。
在莉莉安女学园的高中部，存在着一种叫soeur（法语：姐妹）的系统。像是姐姐带领着妹妹一样，学姐指导着学妹，就算没有严厉的校规，也能传承纯洁正派的学园生活。
学园由相当于普通学校学生会的山百合会管理，其正式的干部成员只有“红蔷薇”“黄蔷薇”“白蔷薇”3位蔷薇大人。蔷薇大人的妹妹们则称为花蕾，作为下届的蔷薇，被大家所认同。
某天清晨，学园的普通一年级生福泽祐巳在向圣母玛利亚的雕像祷告时，被人从后面叫住了。而声音的主人就是红蔷薇的花蕾，莉莉安女学园的明星，小笠原祥子……
小小的领巾促成了命运的邂逅，也拉开了这段美丽少女物语的序幕。
留宿在学校的“学园生活部”的4名成员，气氛制造者的由纪、喜爱铲子（？）的胡桃、带领着大家的悠里、可靠的学妹美纪。在温柔的顾问慈姐的守护之下，她们早上起来拿面包干当早餐，在屋顶的菜园收获小西红柿，追着从房间里逃出来的小狗“太郎丸”跑遍整个学校……虽然有时也会发生些不得了的事情，但大家一起生活的每一天仍然满溢着在那之上的快乐。她们的“学园生活部”今天也元气满满地活动中！
然而，在这份看似幸福的日常中却隐藏着……
某天于地球上空出现许多孢子，其中诞生的幼虫侵入身体后，以寄生脑部为目标，寄生完成后与脑部细胞同化，管理这个“死掉的身体”。它们能任意变形，其食物便是与寄生体相同的物种。由于寄生生物的出现，到处频传残忍的杀人事件，但人类却淡漠地忽视这种仍属少数的案件，而寄生生物逐渐了解人类世界，学会开始计划组织并利用政治的力量，使世界陷入恐慌中。男主角泉新一就是被寄生生物寄生的人类之一，但是由于某种意外，寄生在他体内的生物并没有吃掉他的大脑，而只是取代了他的右手。本性善良正直的泉新一没有被这突如其来的残酷命运击倒，为了被寄生生物杀死的亲友以及所有人类的未来，他决心与其他完全体寄生兽进行殊死搏斗。
近未来的警世预言！
为了防止地球暖化，日本政府决定将东京完全森林化，
但是，那里绝非理想国香格里拉！
21世纪中叶，由于地球暖化造成环境危机，联合国决定强制向各国征收「碳排放税」，以期降低碳排放量。但是日本关东地区发生史无前例的强烈地震，市区完全崩毁，加上日本政府缴不出碳税，因此决定放弃东京，使其成为全世界最大的「森林区」，藉以吸收二氧化碳，减少碳税支出。
同时，日本政府也向东京一千万居民承诺，将于东京上空透过人造建地，打造一个名为「亚特拉斯」的新市区，在空中重建东京及政府组织。在亚特拉斯建造期间，东京的土地逐步被广大的造林地取代，许多住民被迫流离失所，由于暖化在森林区中繁衍开来的热带植物，也引发了早已绝迹的多种热带传染疾病，加上气候的异常，东京市区不断降下暴雨，每每造成大范围的淹水。昔日繁盛热闹的东京市区，俨然成为一座灰暗的死城。
然而，兴建完成的新市区亚特拉斯实际上只能容纳三百五十万人，多数人民无法移居进去，只能在宛如人间炼狱的地面上不断苟延残喘。难民不满的情绪逐渐高昂，激进派反政府组织——「金属世纪」应势崛起，采取激烈的手段，誓言与万恶的日本政府抗争到底。
金属世纪的新一代领袖北条国子是一名18岁女高中生，拥有过人的敏锐直觉，肩负引领「金属世纪」人民的重责大任。因为自己的直觉，她时常能在自己心中听到一个说话声，她试图掌握话声来源，意外发现竟是来自亚特拉斯。国子的内心深信不疑──亚特拉斯正在呼唤她……
故事以三名亚特拉斯候选继承人为主轴展开：
太阳──反抗军「金属世纪」领袖北条国子
大地──日本政府军陆军少尉草薙国仁
月亮──超能力古典美少女美邦
一个寒冷雪夜，幼小的黑主优姬意外遇上一名吸血鬼。在这个吸血鬼向优姬露出獠牙的生死时刻，一个名叫玖兰枢的纯血种吸血鬼救了她，并将她带到黑主学园请求理事长（黑主灰阎）收留。黑主学园除了一般学生就读的日间部外，还有为了吸血鬼与人类能够和谐相处的，由理事长与玖兰枢合作创办的夜间部。在夜间部就读的学生都是十分俊美优秀的人物，不过这里却隐藏着不为日间部学生所知的秘密－－夜间部的学生全都是吸血鬼。
十年后，为了维持学院安宁，优姬和同样被院长收留的锥生零一起担任学园的“风纪委员”，守护着这个秘密。而最受人尊敬的，也是优姬非常倾慕的玖兰枢，更是被称为“吸血鬼中的吸血鬼”的纯血种吸血鬼一族中玖兰家族的始祖，是站在吸血鬼金字塔端的最高种族之一。如果被纯血种咬过，就会变为LEVELD（曾经是人的吸血鬼，在经过一段时间就会因为无法承受吸血鬼的力量堕落为LEVELE）。而锥生零作为吸血鬼猎人，却在一次家难中不幸被纯血种的绯樱闲咬伤。绯樱闲杀死了零的家人，带走了他的弟弟锥生一缕，零非常憎恨吸血鬼（特别是纯血种）。优姬为抑制零的继续堕落，多次让他吸自己的血。
被称为地狱门的不可侵领域突然出现在东京。 真正的星空消失，取而代之的是虚假的星星。世界各地开始出现被称为“契约者”的超能力者。这些本是普通人类的能力者丧失冲动的情感，只遵循“合理性”而行动。围绕“门”的谜团，各国势力和契约者们展开了殊死的利益争夺。