主人公润和有泉奈这个亲妹妹，进学校时是极其普通的高中生。可是，在过去被卷入父母死亡的事故，润和自己也丢失了以前的那段记忆，幸存下来的润和被亲戚照顾着，与只剩下一人的骨肉亲人泉奈一起持续着二人生活。然后，现在……开始和泉奈上相同的高中，对两人来说，那里让他们忘记过去而快乐。新的生活，环境，还有初遇。对原来生活在只有妹妹存在的世界的润和来说，在这个街的生活分外的新鲜。 可是，不久润和由于事故而丢失了的记忆开始恢复后，在幸福快乐的生活中，对过去和现在和未来摇摆不定的润和……所谓被润和的记忆掩盖了的真实是…
——华生追寻挚友失却的灵魂的旅程
「经证实，与生前相比，人死后体重会减轻21克。这就是灵素的重量，也就是所谓灵魂的重量。」
19世纪末，「死者复活技术」高度发展，尸者作为劳动力得到广泛应用。伦敦的医学生约翰·华生，在明知违法的情况下，将死去的挚友星期五做成了尸者。而这也是星期五生前托付给华生的殷切愿望。
华生的违法行为被谍报机构「沃尔辛厄姆」发现，华生也因此受命去搜索《维克多手记》。《维克多手记》是一百年前维克多·弗兰肯斯坦博士遗留的文书。据信在那里面写有，孕育出据传与生者同样拥有意识的最初的尸者The One的终极的技术。
华生与星期五从印度孟买向阿富汗内陆进发。目标是沙皇俄国牧师、天才尸者技术者阿列克塞·卡拉马佐夫。与新型尸者一同消逝在那里的卡拉马佐夫，或许拥有《维克多手记》。
华生与英国军人伯纳比汇合后，由俄罗斯的特务尼古拉带路开始行动。未尝想到，这只是华生周游世界的冒险的起点。从阿富汗到日本，再到美国，华生的冒险如此持续下去。
让星期五再度获得灵魂——华生的夙愿，能够在旅途的终点得以实现吗？
《和谐》发生在《屠杀器官》结束后数十年。经历了「大灾祸」的世界动乱，人类终于实现以医疗经济为架构的全新社会，在全新统治机构「生府」的管理下，人人过着健康良好的日常，然而和平底下却是用纳米机械来监视人体的可悲生活，此时三名少女踏上了反抗这一切的道路。
生存在现实世界的人们，总是不得不面对各种各样不合理的事。各自的人生经历、朋友关系、家人，以及对未来的恐慌。当某一个人最终的结局——“死亡”来临之时，已死去或者依然活着的人，是否已经了无遗憾？
“如果，能够将死去的人最后的遗言传递给活人……”流传在都市角落里的传说，正是跟一个总是将死者最后的遗言传递给生者的少女有关。这种由已经死去的人，寄给依然活着的人的信，被称为“死后文”，负责传递这种奇妙信件的少女，就是来自于死后世界的邮递员文伽。
死后文里记载的，是死去的人从人世间所带走的最后情感。有怨恨，有思念，有悲伤，有喜悦…文伽见证着死者与生者的种种羁绊，并看透了世间的人情百态。甚至于众多难以想象的诡计与阴谋，也都在死后文里揭露出了原本的面目。
对于用鲜血和虚伪所掩盖的真实来说，死亡，绝不是人类最后的终点……
在某私立学校（私立アミティーエ学园）上学的主人公长濑准一和妹妹长濑凑一起过着只有两人的平凡生活。一天傍晚，准一在街上救了一名被不良少年拉住的少女，事后不但忘记告诉少女自己的名字，同时还被仓皇逃去的不良少年喊出了当初的黑暗称号“下中的Genokiller”（Genocide killer-大量虐杀者/灭绝屠戮者）。
第二天，准一的班上来了一个转校生，她正是准一前一天所救的少女：片桐优姬，片桐财团的大小姐。两人成为了好朋友，但是在损友的鼓促呼巄下，当着全班的面吻了优姬，因而被她讨厌，但当天傍晚优姬却出现在准一家门前，并透露了婚约之事，之后展开了三人同居的日子，痛苦和甜蜜关系即将开始，准一的生活会发生什么样的变化呢……
在和美丽吸血鬼遭遇的春假之后，主人公阿良良木历迎来新学期，从新学期的第1个月开始到大学入学考试为止，这1年间每个月所经历的故事。
故事将从2001年起回溯到18年前。1978年巴莱奥罗格斯作战大败，次年波兰陷落。由于这两个原因，东德在1983年成为欧洲防卫的最前线，炽烈的战火开始蔓延。 由于BETA集群的大规模攻势，东德部队的防线陷入了困境。 东德的头号战术机甲部队，第666战术机甲中队“Schwarzes marken”受命，须以区区8骑的战力去消灭布阵在后方的光线级BETA，以逆转战局。 面对数目庞大的BETA，暴雪不断的恶劣天气，以及国家权力施加在自己的头上的重压，被迫在严酷的条件下进行作战，他们的命运将走向何方。
故事主要讲述了3个少女和9个少年去旅行。 像明治大正一样的古老街道， 街上的人们皆穿着日式服装， 并且存在着与那样的街道极不相称的巨大球体。 仿佛丢失了重力这个概念一样慢慢地在空中飘浮着， 那个球体的名字是「NORN」。是载着年轻人们在天空旅行的广大的船……
结果战争并没有消失。
但是有了变化。在人类默默进行无聊的彼此杀戮之中产生变化。
超大型武器——OBJECT。
它的出现改变了战争的一切。
派遣到战场留学的学生，库温瑟，在整备基地遇见带着奇妙氛围的少女。人称“ELITE”的那名少女——正是“OBJECT”的驾驶员。
在不久的将来，这名微不足道的少年将会为了这名少女，以个人的血肉之躯对抗最强的武器“OBJECT”。
这次邂逅就是一切的开端——
哈尔希洛从一片黑暗中醒来。这是什么地方，为何身在此地，以及，自己从何处而来，这一切皆是不知。周围是数名与自己境遇相同的男女。他们一同从黑暗中踏出，前方展开的是未曾见过的，名为「格林姆迦尔」的世界……记忆、金钱、特别的力量——什么都没有的的现实里，他们渐渐认识到：生存，并不简单。