历经百年的时光，将人类与外侧世界隔开的墙壁。在墙壁的另一侧，似乎有前所未见的世界延伸开来。
火焰之水、冰之大地、砂之雪原……。记载在书中的，尽是些激发少年探究心的文字。
在时间流转，墙壁被巨人毁坏的现在，人类正一步步接近世界的真相。
巨人的真实身份是什么？为何墙壁中会埋着巨人？巨人化的艾伦·耶格尔所持有的“坐标”之力是？以及，西斯托利亚·雷斯究竟知道这个世界的什么事情？
在艾伦等104期兵的加入下，建立新体制的利威尔班。最强最恶的敌人，阻拦在开始行动的他们面前。
时为战乱年代。
醍醐之国的领主景光，在某所寺院的大堂中，向十二魔神像许愿让自己的领土繁荣。而诞生的景光之后嗣作为代价，身体各处都有所欠缺，被视作不祥之子而抛弃到河川之中。时光流逝，鬼神实现了与景光的约定，国家迎来了繁荣。这样的某天，名为“多罗罗”的年幼盗贼，与某个男人相遇。
那是鬼，还是人——
两臂装有刀剑，全身皆为人造的男人“百鬼丸”，以他那无神光的双瞳紧紧盯着袭来的妖魔。
不明白与人恋爱的心情，为此感到烦恼的小糸侑，在初中毕业时被要好的男生告白，却无法给予回应。
她在此时邂逅的学生会成员七海灯子，不论被谁告白，都无法喜欢上对方。
与灯子感到共鸣的侑，将自己的烦恼坦诚相告，却反而从灯子那里听到了意想不到的话语——
“我好像会喜欢上你。”
舞台为浅草。初中二年级的矢逆一稀、久慈悠、阵内燕太三人在某天，与神秘的河童型生命体“Keppi”相遇，并被强行夺走了尻子玉而变身成为了河童。
“想要变回原状的话，就通过‘某个方法’来产生联系，并把僵尸的尻子玉拿来吧”Keppi如此告知他们三人。少年们能否相互产生联系，并夺取僵尸的尻子玉呢？！与此同时，新星玲央和阿久津真武执勤的派出所，似乎也发生了什么。
“学园都市”是位于东京西部的巨大都市。在这总人口超过230万、其中约8成人口是学生的都市中，学生们接受开发超能力的特殊课程，并且被依能力区分为“无能力（Level0）”到“超能力（Level5）”的六阶段。
上条当麻也是居住在学园都市的学生之一。由于寄宿在他右手的力量—只要是异能之力，就算是神之加护也能加以消除的“幻想杀手”，使得他被评价为吊车尾的“无能力”，过着着充满不幸的人生。
传说。神话。魔法。 随着科学的发展逐渐被人们遗忘，然后，在另一个世界里，终于再次和人们邂逅。但是，那再会并非是幸福的。受到来自地冥界怪物们侵袭的现在，人类拥有的多数武器皆已无效，命运如同风中残烛。此时，同样受到地冥界侵袭所苦的精灵环境条约机构对人类伸出了援手，人类得到了一丝起死回生的希望。那就是“魔法少女”。有着强大力量的少女们，即使身心皆已满目疮痍，仍然引导著人类获得胜利，最终结束了大战。即便如此，这不过只是为新的战斗揭开了序幕。国际犯罪，无差别恐攻，内战，纷争……。魔法少女的战斗不会止息——
人们从出生开始就被赋予了一本书。从生到死按照“命运之书”记载的脚本生存下去的宿命。
在此之中，持有空白脚本的“空白之书”出生的艾克斯，与同样拥有“空白之书”的同伴们相遇，踏上了寻找自己使命的旅程。
这是一部被不断阅读过的童话故事。
在这趟旅途的前方，是新的命运。全世界被产业革命的波澜推动，自近世变迁至近代之时，不死的怪物突然出现。这些后来被称为卡巴内的怪物，拥有被钢铁皮膜包覆的心脏，但凡被它们啃咬的人也会变成巴卡内。卡巴内爆发性地增殖，并覆盖了全世界。在远东岛国日本，乘搭着被厚重装甲覆盖的蒸汽机车（通称“骏城”）之一的甲铁城上的生驹等人，经过激烈的战斗，终于到达了卡巴内与人类的新的攻防战地点——面向日本海的废弃驿“海门”。生驹他们与同样想从卡巴内手里夺回“海门”的玄路、虎落、海门的人民组成“联合军”，谋划击退卡巴内的策略，但是，“海门”这个地方却埋藏着某个“秘密”……
以被红色的雾所覆盖、荒废的建筑物所包裹的无人世界为舞台，讲述了三姐妹与被称作“虫”的异形怪物战斗的求生故事。
故事的核心人物是以盘发为特征的凛、稳重大方的猫耳大姐律、穿着女仆装的天真烂漫的气氛制造者鸣。在谜团重重的世界里，姐妹的目标究竟是……
阿良良木历的故事结束了。
从地狱一般的春假开始，
经过了无数的磨难，
阿良良木历高中生活的最后一年就这样结束了
——原本是这样的。
但是毕业典礼结束的第二天早上，发生了意想不到的事情。
历，被困在了镜中的世界。
就这样，既不是高中生，也不是大学生，
在这样的时间里阿良良木历体验到的，
终结了的，后续的故事。