《那朵花》是一部用直达内心的笔触描写青春期的少男少女在面对恋情、友情、纠葛时，有欢欣笑容也有伤心泪水的青春原创动画片。
从小时候起一直青梅竹马的6人，却在升上高中之后彼此有了距离。不太与人们接触的主角宿海仁太、有点被小太妹熏染的安城鸣子、进入重点高中的松雪集与鹤见知利子、放弃读高中而展开旅行的久川铁道、只有幼年死去的本间芽衣子（灵魂，只有仁太能看见）还是一如从前。有一天，芽衣子对仁太说：“帮我实现一个愿望吧”。仁太虽然有点为难，却还是答应帮助面码实现愿望。以此为契机，为了实现芽衣子的愿望，分散在各处的大家又再次地聚集在一起。
泡沫战争十数年来，世界富人和穷人的两极分化急剧地发展，日本也没有例外。富人只顾寻求自己的欲望和快乐，东京化作了满足这种欲望的快乐都市。在某个秘密俱乐部里，那是个只有特别选出的人才能被允许出入的的黑暗的社交场。而且会员中有人还能被赐予终极的快乐。
被剥夺了护照，只好呆在国内的战地摄影记者杂贺，某天被托付了潜入哪个秘密俱乐部取材的任务。在杂贺抓拍现场的同时一名叫天王洲神乐的神秘女子突然出现，其实哪女子是被俱乐部支配人水天宫作为俱乐部的象征操纵着。神乐开始向杂贺求助，因为同神乐的接触而得到了奇妙能力“写杀”的杂贺便带着神乐逃出了俱乐部。后遭了水天宫所命令来自俱乐部的追赶者，也是根据欲望得到了“特殊能力”的人们所追杀而发生的一系列事件。
在学校总是独来独往的羽濑川小鹰，在一次偶然的情况下
邻人社社员介绍，目击到总是摆出一副臭脸的美少女三日月夜空一个人很开心地自言自语。
“难、难道你看得见幽灵之类的东西？”
“我只是在跟朋友讲话而已，跟我的空气朋友讲话！”
（这家伙没救了……）
小鹰和夜空聊了一下该怎麼交朋友的话题，没想到夜空竟然凭著莫名其妙的行动力成立一个以交朋友为目的的问题社团。
而且也不知道是哪里搞错，问题美少女们还接二连三地申请入社！
大家卯起来打美少女游戏电玩，一起去游泳、一起演戏。
似乎一直没有抓对要领的他们，果真能交到朋友吗？
作品以21世纪初的日本某乡镇为舞台，描绘著一名高中少年“阿良良木历”与少女们遇到许多日本民间传说的怪谭故事。本作品跟一般怪谭故事不同，不以击退妖怪或寻找事发原因之类的解谜作为主线。作品主要透过对话，为男主角和少女们之间的内心作深刻描写。对话多到让主要事件差点完全中断，亦加入了许多后设以及对社会和其他作品的讽刺。故事之中还加入了恋爱喜剧，以及详细的动作元素，可说是作者把想要的东西都写进去的作品。所以，作者自评本作为他的自信作，亦称之为“以很难媒体化为目的而写的小说”。
女主角桃园奈奈生因好赌而欠债的父亲不知去向，被讨债的人赶出了家。在走投无路之时，她帮助了一位被狗追的懦怯的男人，得知她的遭遇后神秘的男人说出了“我把我的家转让给你吧。”这样出奇的话。无家可归的奈奈生虽然半信半疑，但还是前往了男人所说的住所……到了那儿发现那是一间荒废的神社。那懦怯的男人的正体正是离家出走的土地神。作为神社转让的代价，奈奈生开始了当土地神的新生活。
游戏业界是一个与现实相异的世界，存在着四个由女神统治的国家：Planeptune、Lastation、Leanbox和Lowee，四个国家为了争夺女神力量之源“Share”而展开长期战争。但是，因惧怕长期战争导致国力衰弱，女神们最终缔结了禁止武力争夺Share的《友好条约》。就这样，游戏业界迈向崭新的未来，四个国家的女神和候补生妹妹也开始了新的生活。
一宫恵瑠奈在初中时期过着单纯的御宅生活。在亲人与表哥二宫时雨的说服下开始挑选想要就读的高中，挑选条件毫无疑问是“可爱的制服”。最终挑选的结果是私立御神乐学园，虽然原本因为“二宫就读”而在最初就剔除，不过一宫在招生指南上看到御神乐星锁穿着制服的模样后马上就回心转意。不过，开学当天对今后生活心情激动的一宫，却在新生欢迎会上见到学长姐们暴走的身影。而且，这所学校里存在着“一个月内未参加任何社团活动的人将被强制退学”这样的校规。一宫能在学园中度过理想中的校园生活吗?
故事讲述来自因帝国镇压而痛苦不堪的村子的少年剑士塔兹米和幼驯染的伙伴一起出发前往帝都谋生，在抵达帝都的途中遇到歹徒夜袭，与伙伴分离孤单一人到达了帝都。在到达帝都的第一天就被骗光了所有钱的塔兹米，被贵族的大小姐艾莉亚收留回家。在一次与艾莉亚一起去买东西的途中，意外地得知了帝都黑暗的真相。此后塔兹米与帝都的无情杀手集团NIGHT RAID的赤瞳相遇，决定以NIGHT RAID一员的身份对抗帝都的所有恶势力。
在现实中，坂本龙太是一个个性孤僻沉默寡言的宅男，但在网络游戏“BTOOOM！” 里，龙太则化身成为了实力超强的世界级玩家。令龙太意想不到的是，在某一天，本该属于虚拟世界中的厮杀蔓延到了现实世界里来，连他在内的数十位男女被某个神秘组织强制带往了一个荒岛上，在那里，进行着与网络游戏同名的真人游戏。为了生存，龙太必须利用自己的能力同素不相识的陌生人们战斗到底。
金发碧眼的少女卑弥呼，曾经的好友织田信隆，狡猾残暴的今川义名，有着双重人格的吉良康介，他们为何会被卷入这场游戏？又是谁在背后操控着大局？一切尚在迷雾之中。
某一天，最强的魔法使公主锁部叶风被部下左门暗算，困在了无人荒岛；又有一天，一位少女被唐突杀害，犯人还未逮捕时间却已流逝；然后又在某一天，围绕着复仇与魔法，超越时间与空间战斗正式揭开了序幕！正气和狂气，理性和知性，自信和确信。在悲剧性的不合理的世界里，少年少女们的命运交缠纠结，故事开始了。